Se cree que antes de la existencia de lo que hoy conocemos como Alcazaba, en el mismo cerro existía una rábida cuya construcción fue fechada a mediados del siglo IX, con la intención de defender los arrabales de los normandos entre los años 840 y 861.15​ Se diseñó como una edificación de defensa ubicada dentro de la ciudad de Almería, exactamente en el norte del Casco Histórico. Una alcazaba es una ciudadela construida en varios niveles que suele ocupar toda una elevación de terreno. Tiene muros con torres de defensa, calles, casas y mezquita.
En el año 955 Abderramán III concede a Almería la categoría de medina. Es en ese momento cuando se comienza a construir la Alcazaba. Se construye también la mezquita aljama, cuyos restos son visibles en la iglesia de San Juan, y las murallas que rodean la ciudad. La Alcazaba fue una fortaleza militar y al mismo tiempo sede del gobierno. Desde este lugar se domina la ciudad y el mar. Se perfeccionó todo el conjunto y se engrandeció con Almanzor y más tarde alcanzó su máximo esplendor con Jairán, primer rey de la Taifa de Almería, entre los años 1012 y 1028.
Su entrada se encuentra en la calle Almanzor, paralela a la muralla, que lleva tras unas escaleras en zig zag rodeadas de vegetación al primer recinto del castillo, tras la Puerta de la Justicia.

Primer recinto

Es una gran plaza, que correspondía a un antiguo campamento militar y refugio para la población en caso de asedio, y estaba dividida en dos barrios, además de un pequeño cementerio. Existían buenos aljibes, uno de los cuales podemos ver hoy en ruinas excavadas, y uno de los pozos que elevaba agua a 70 metros de altura. La entrada se realiza a través de la llamada Torre de los Espejos, que alberga la Puerta de la Justicia. Según la tradición, esta torre albergaba un sistema de espejos cuya finalidad era avisar a los barcos que llegaban al puerto, esperar una respuesta y así detectar al enemigo. En el extremo oriental se encuentra el Baluarte del Saliente, que ahora alberga las oficinas del monumento.

Alrededor de 1522, un terremoto destruyó gran parte de la ciudad y dejó graves daños en esta zona. Aunque se conoce el uso de este lugar, su aspecto original es completamente desconocido, ya que no se han encontrado documentos ni imágenes que describan la distribución interior del complejo original. Por ello, durante la restauración de la Alcazaba, se decidió crear una serie de jardines y elementos ornamentales inspirados en la Alhambra de Granada. Los suelos pavimentados, los pequeños canales que fluyen con el agua a través del terreno irregular, los setos, las pequeñas fuentes y los árboles son elementos cuya ubicación original se desconoce, pero que enriquecen la visita.

Muro de la Vela. El Muro de la Vela separa la primera zona de la segunda, aunque se accede desde esta última. Su nombre se debe a que allí se alzaba la Campana de la Vela, que anunciaba diversos acontecimientos: la entrada de barcos a la bahía, peligro, incendios, etc. Su construcción fue mandada a construir por el rey Carlos III. La campana animaba a los defensores de la fortaleza con su repique. En otras ocasiones, se utilizaba para marcar la hora del riego, como toque de queda, y para señalar el cierre de las puertas de la muralla y la salida de las patrullas. También se oía en las noches de tormenta. Está protegida por una cruz y tiene un nombre: Santa María la Mayor (todas las campanas tienen un nombre propio).

Segundo recinto

Fue residencia de gobernantes, guardias y sirvientes. En realidad, era una ciudad palaciega con edificios como una mezquita, una casa, baños, cisternas, tiendas, etc. También existen baños militares, inspirados en las termas romanas. Debido a los terremotos que devastaron la provincia en la época moderna, se conservan pocos restos, pero ofrece un amplio yacimiento arqueológico que aún se estudia. Hoy en día, se puede visitar el aljibe, el Muro de la Vela y la Ermita de San Juan, una antigua mezquita reconstruida por los Reyes Católicos. Los baños militares y dos réplicas de casas originales, reconstruidas a partir de sus ruinas en la década de 1960 y que albergan exposiciones de objetos de ese período, se llevan a cabo desde 2020. Se han reanudado las excavaciones arqueológicas en la segunda zona, dirigidas por el MEMOLab de la Universidad de Granada.

Ermita de San Juan. Fue construida entre 1490 y 1523 y actualmente se utiliza como pequeño auditorio. Mirador de la Odalisca. En la segunda zona, aún se conserva en el lado norte una muralla correspondiente al palacio de Almotacín, del siglo XI, con dos aberturas al barranco de La Hoya. Existe una leyenda relacionada con este lugar. Antes de que este sitio cayera en desuso, esta era la residencia de Almotacín, donde mantenía un harén. Una noche, el rey tuvo que esperar a su concubina favorita, llamada Galiana. De hecho, ella había venido a liberar a una prisionera cristiana que cantaba a su belleza todas las noches. Al descender por esta ventana con la ayuda de unos pañuelos de seda atados por la odalisca, apareció el guardia y decidió soltarse para evitar ser capturado de nuevo. Murió al tocar el suelo. Al ver caer a su amado, la concubina rompió a llorar en el alféizar de la ventana y murió de pena poco después. Esta historia habla de la difícil convivencia entre las dos culturas que existían en la ciudad.

Tercer recinto

Esta es la parte más moderna de todo el complejo. Tras la toma de Almería el 26 de diciembre de 1489, los Reyes Católicos ordenaron la construcción de un castillo en la zona más occidental y elevada, donde anteriormente se alzaba una fortaleza, adaptado a las nuevas necesidades militares y artilleras. La construcción comenzó en 1490 y finalizó en 1534 durante el reinado de Carlos I.29 Esta zona, protegida por tres torres semicirculares llamadas del Homenaje, la Noria y la Pólvora, y un foso, era accesible a través de un puente levadizo. Se desconoce quién pudo haber sido el arquitecto de esta sección de la ciudadela, aunque su diseño, basado en similitudes con otras fortalezas de la época, sugiere que esta persona estaba en contacto con la arquitectura defensiva castellana e incluso italiana del Renacimiento.
El interior se organiza en torno al patio de armas, presidido por la torre del homenaje. Destacan la Torre del Molino y la Torre de la Pólvora. En el centro del patio se encuentran una cisterna rectangular y un silo campaniforme, que antiguamente también servía de calabozo. Los sillares utilizados para construir los muros de este complejo están inscritos con todo tipo de símbolos basados ​​en figuras geométricas. Estos no se añadieron posteriormente, sino que se tallaron durante el proceso. Estas son las firmas de los canteros que trabajaron en ellos, ya que su salario dependía de la cantidad de piedras que pudieran producir. Esto permitió identificar al creador de cada bloque. Basándose en estos rastros, ahora se asume que algunos de estos trabajadores también participaron en la construcción de la catedral de la ciudad, ya que se han encontrado las mismas marcas. Se han contabilizado más de 25 marcas diferentes en toda la zona.

Torre del Homenaje La Torre del Homenaje es la más grande de todas las que rodean la tercera zona de esta ciudadela. A diferencia de las demás, su planta es cuadrada en lugar de circular, lo que refleja su uso como residencia. En la fachada principal, un marco de puerta está preparado para albergar el escudo de armas de Carlos I, aunque nunca se colocó allí. El interior albergó exposiciones del Centro Andaluz de Fotografía hasta noviembre de 2016, tras lo cual se instalaron nuevas exposiciones, especialmente sobre cine.
Torre de la Pólvora La Torre de la Pólvora, situada en el extremo occidental del edificio, se utilizaba para almacenar explosivos para las armas de la fortaleza.
Hacia 1845, se instaló el primer pararrayos de la ciudad como medida de seguridad para prevenir posibles explosiones accidentales, como la ocurrida en 1707 cuando un rayo cayó sobre la ciudad. Para su construcción se utilizaron tres agujas de platino, cada una adquirida en París por 25 francos, además de una aguja de ocho metros de altura y un tanque de evacuación excavado en la colina exterior. El coste final del proyecto fue de 2766 reales de Vellón. Como las arcas de la ciudad no eran suficientes para tales gastos, se solicitaron donaciones a las familias más adineradas de la zona.

Exterior de la Alcazaba

Muralla de Jayrán. La muralla del Cerro de San Cristóbal, más conocida como las Murallas de Jayrán, es el vestigio actual de la antigua muralla que rodeaba toda la ciudad y fue construida por Jayrán, el primer rey de la taifa de Almería. Aunque se han encontrado otros tramos de esta muralla en otras zonas de Almería, como los búnkeres subterráneos cercanos, esta es la única sección que siempre se ha encontrado a cielo abierto y que no se ha descubierto posteriormente en ruinas. Originalmente se llamaba Monte Laham, que significa "carne" en árabe. El nombre católico de Almería se remonta al breve periodo que la ciudad pasó bajo el reinado de Alfonso VII. Durante este período, se construyó un castillo dedicado a San Cristóbal, que ahora se encuentra en un estado de deterioro creciente. Fue construido para proteger el casco antiguo de La Musalla durante el reinado de Abderramán III. Construida entre 1012 y 1028, la muralla tiene tres metros de grosor y cinco metros de altura en un tramo, y cuenta con un total de siete torres: tres de planta cuadrada de origen árabe y cuatro de planta circular de origen cristiano, construidas en 1147 por orden de Alfonso VII. También se conserva una puerta conocida como la Puerta de la Almudaina, que daba acceso a la Estación Experimental de la Zona Árida (EEZA). Los cantos rodados encontrados en el suelo se reutilizaron para restaurar las torres, que fueron destruidas tras los conflictos del siglo XII.
Estatua del Sagrado Corazón de Jesús. Esta estatua fue erigida en 1928 en la cima del cerro de San Cristóbal. Está realizada en mármol de la localidad almeriense de Macael. Fue demolido inmediatamente después del estallido de la Guerra Civil Española y reconstruido posteriormente en 1944. Finalmente fue restaurado en el año 2000.